Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Ttc9Q3V038 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Ttc9Q3V038 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Ttc9Q3V038 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Ttc9Q3V038 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Ttc9Q3V038 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms