Protein–RNA interactions for Protein: Q3V016

Hipk4, Homeodomain-interacting protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk4Q3V016 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.5 ms