Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV55

Nr1d1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d1Q3UV55 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms