Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms