Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms