Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPH7

Arhgef40, Rho guanine nucleotide exchange factor 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef40Q3UPH7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Arhgef40Q3UPH7 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Arhgef40Q3UPH7 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Arhgef40Q3UPH7 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Arhgef40Q3UPH7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Arhgef40Q3UPH7 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Arhgef40Q3UPH7 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Arhgef40Q3UPH7 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Arhgef40Q3UPH7 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Arhgef40Q3UPH7 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Arhgef40Q3UPH7 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Arhgef40Q3UPH7 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Arhgef40Q3UPH7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Arhgef40Q3UPH7 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Arhgef40Q3UPH7 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Arhgef40Q3UPH7 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Arhgef40Q3UPH7 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Arhgef40Q3UPH7 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Arhgef40Q3UPH7 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arhgef40Q3UPH7 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arhgef40Q3UPH7 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arhgef40Q3UPH7 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arhgef40Q3UPH7 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arhgef40Q3UPH7 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arhgef40Q3UPH7 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arhgef40Q3UPH7 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arhgef40Q3UPH7 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arhgef40Q3UPH7 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arhgef40Q3UPH7 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arhgef40Q3UPH7 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arhgef40Q3UPH7 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arhgef40Q3UPH7 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arhgef40Q3UPH7 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Arhgef40Q3UPH7 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Arhgef40Q3UPH7 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Arhgef40Q3UPH7 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Arhgef40Q3UPH7 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Arhgef40Q3UPH7 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Arhgef40Q3UPH7 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Arhgef40Q3UPH7 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Arhgef40Q3UPH7 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Arhgef40Q3UPH7 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Arhgef40Q3UPH7 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Arhgef40Q3UPH7 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Arhgef40Q3UPH7 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Arhgef40Q3UPH7 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Arhgef40Q3UPH7 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Arhgef40Q3UPH7 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Arhgef40Q3UPH7 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Arhgef40Q3UPH7 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Arhgef40Q3UPH7 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Arhgef40Q3UPH7 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Arhgef40Q3UPH7 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Arhgef40Q3UPH7 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Arhgef40Q3UPH7 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Arhgef40Q3UPH7 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Arhgef40Q3UPH7 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Arhgef40Q3UPH7 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Arhgef40Q3UPH7 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Arhgef40Q3UPH7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Arhgef40Q3UPH7 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Arhgef40Q3UPH7 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Arhgef40Q3UPH7 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Arhgef40Q3UPH7 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Arhgef40Q3UPH7 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Arhgef40Q3UPH7 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Arhgef40Q3UPH7 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Arhgef40Q3UPH7 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Arhgef40Q3UPH7 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Arhgef40Q3UPH7 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Arhgef40Q3UPH7 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Arhgef40Q3UPH7 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Arhgef40Q3UPH7 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Arhgef40Q3UPH7 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Arhgef40Q3UPH7 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Arhgef40Q3UPH7 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Arhgef40Q3UPH7 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Arhgef40Q3UPH7 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Arhgef40Q3UPH7 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Arhgef40Q3UPH7 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Arhgef40Q3UPH7 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Arhgef40Q3UPH7 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Arhgef40Q3UPH7 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Arhgef40Q3UPH7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Arhgef40Q3UPH7 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Arhgef40Q3UPH7 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Arhgef40Q3UPH7 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Arhgef40Q3UPH7 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Arhgef40Q3UPH7 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Arhgef40Q3UPH7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Arhgef40Q3UPH7 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Arhgef40Q3UPH7 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Arhgef40Q3UPH7 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Arhgef40Q3UPH7 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Arhgef40Q3UPH7 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Arhgef40Q3UPH7 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arhgef40Q3UPH7 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arhgef40Q3UPH7 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arhgef40Q3UPH7 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arhgef40Q3UPH7 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
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