Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL53

Crxos, Cone-rod homeobox, opposite strand, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxosQ3UL53 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CrxosQ3UL53 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CrxosQ3UL53 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CrxosQ3UL53 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CrxosQ3UL53 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CrxosQ3UL53 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CrxosQ3UL53 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CrxosQ3UL53 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CrxosQ3UL53 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CrxosQ3UL53 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CrxosQ3UL53 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CrxosQ3UL53 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CrxosQ3UL53 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CrxosQ3UL53 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CrxosQ3UL53 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CrxosQ3UL53 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CrxosQ3UL53 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CrxosQ3UL53 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CrxosQ3UL53 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CrxosQ3UL53 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CrxosQ3UL53 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CrxosQ3UL53 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CrxosQ3UL53 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CrxosQ3UL53 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CrxosQ3UL53 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CrxosQ3UL53 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CrxosQ3UL53 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CrxosQ3UL53 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CrxosQ3UL53 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CrxosQ3UL53 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CrxosQ3UL53 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CrxosQ3UL53 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CrxosQ3UL53 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CrxosQ3UL53 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CrxosQ3UL53 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CrxosQ3UL53 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CrxosQ3UL53 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CrxosQ3UL53 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CrxosQ3UL53 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CrxosQ3UL53 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CrxosQ3UL53 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CrxosQ3UL53 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CrxosQ3UL53 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CrxosQ3UL53 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CrxosQ3UL53 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CrxosQ3UL53 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CrxosQ3UL53 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CrxosQ3UL53 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CrxosQ3UL53 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CrxosQ3UL53 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CrxosQ3UL53 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CrxosQ3UL53 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CrxosQ3UL53 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CrxosQ3UL53 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CrxosQ3UL53 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CrxosQ3UL53 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CrxosQ3UL53 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CrxosQ3UL53 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CrxosQ3UL53 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CrxosQ3UL53 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CrxosQ3UL53 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CrxosQ3UL53 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CrxosQ3UL53 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CrxosQ3UL53 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
CrxosQ3UL53 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CrxosQ3UL53 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CrxosQ3UL53 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CrxosQ3UL53 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CrxosQ3UL53 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CrxosQ3UL53 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CrxosQ3UL53 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CrxosQ3UL53 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CrxosQ3UL53 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CrxosQ3UL53 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CrxosQ3UL53 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CrxosQ3UL53 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CrxosQ3UL53 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CrxosQ3UL53 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CrxosQ3UL53 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CrxosQ3UL53 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CrxosQ3UL53 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CrxosQ3UL53 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CrxosQ3UL53 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CrxosQ3UL53 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CrxosQ3UL53 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CrxosQ3UL53 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CrxosQ3UL53 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CrxosQ3UL53 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CrxosQ3UL53 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CrxosQ3UL53 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CrxosQ3UL53 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CrxosQ3UL53 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CrxosQ3UL53 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CrxosQ3UL53 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CrxosQ3UL53 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CrxosQ3UL53 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CrxosQ3UL53 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CrxosQ3UL53 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CrxosQ3UL53 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CrxosQ3UL53 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms