Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKP4

Ceacam12, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 12, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ceacam12Q3UKP4 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ceacam12Q3UKP4 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ceacam12Q3UKP4 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ceacam12Q3UKP4 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ceacam12Q3UKP4 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ceacam12Q3UKP4 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ceacam12Q3UKP4 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ceacam12Q3UKP4 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ceacam12Q3UKP4 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ceacam12Q3UKP4 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ceacam12Q3UKP4 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ceacam12Q3UKP4 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ceacam12Q3UKP4 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ceacam12Q3UKP4 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ceacam12Q3UKP4 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ceacam12Q3UKP4 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ceacam12Q3UKP4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ceacam12Q3UKP4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ceacam12Q3UKP4 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ceacam12Q3UKP4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ceacam12Q3UKP4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ceacam12Q3UKP4 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ceacam12Q3UKP4 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ceacam12Q3UKP4 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ceacam12Q3UKP4 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ceacam12Q3UKP4 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ceacam12Q3UKP4 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ceacam12Q3UKP4 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ceacam12Q3UKP4 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ceacam12Q3UKP4 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ceacam12Q3UKP4 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ceacam12Q3UKP4 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ceacam12Q3UKP4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ceacam12Q3UKP4 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ceacam12Q3UKP4 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ceacam12Q3UKP4 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ceacam12Q3UKP4 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ceacam12Q3UKP4 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Ceacam12Q3UKP4 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Ceacam12Q3UKP4 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Ceacam12Q3UKP4 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Ceacam12Q3UKP4 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Ceacam12Q3UKP4 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ceacam12Q3UKP4 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ceacam12Q3UKP4 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ceacam12Q3UKP4 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ceacam12Q3UKP4 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ceacam12Q3UKP4 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ceacam12Q3UKP4 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ceacam12Q3UKP4 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ceacam12Q3UKP4 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ceacam12Q3UKP4 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ceacam12Q3UKP4 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ceacam12Q3UKP4 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ceacam12Q3UKP4 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ceacam12Q3UKP4 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ceacam12Q3UKP4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ceacam12Q3UKP4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ceacam12Q3UKP4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ceacam12Q3UKP4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ceacam12Q3UKP4 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ceacam12Q3UKP4 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ceacam12Q3UKP4 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ceacam12Q3UKP4 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ceacam12Q3UKP4 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ceacam12Q3UKP4 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ceacam12Q3UKP4 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ceacam12Q3UKP4 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ceacam12Q3UKP4 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ceacam12Q3UKP4 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ceacam12Q3UKP4 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ceacam12Q3UKP4 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ceacam12Q3UKP4 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ceacam12Q3UKP4 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ceacam12Q3UKP4 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ceacam12Q3UKP4 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ceacam12Q3UKP4 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ceacam12Q3UKP4 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ceacam12Q3UKP4 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ceacam12Q3UKP4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ceacam12Q3UKP4 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ceacam12Q3UKP4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ceacam12Q3UKP4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ceacam12Q3UKP4 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ceacam12Q3UKP4 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ceacam12Q3UKP4 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ceacam12Q3UKP4 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ceacam12Q3UKP4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ceacam12Q3UKP4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ceacam12Q3UKP4 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ceacam12Q3UKP4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ceacam12Q3UKP4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ceacam12Q3UKP4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ceacam12Q3UKP4 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ceacam12Q3UKP4 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ceacam12Q3UKP4 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ceacam12Q3UKP4 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ceacam12Q3UKP4 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ceacam12Q3UKP4 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ceacam12Q3UKP4 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms