Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKJ7

Smu1, WD40 repeat-containing protein SMU1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 513 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smu1Q3UKJ7 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Smu1Q3UKJ7 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Smu1Q3UKJ7 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Smu1Q3UKJ7 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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