Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms