Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf180Q3U827 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf180Q3U827 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf180Q3U827 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf180Q3U827 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf180Q3U827 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf180Q3U827 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf180Q3U827 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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Rnf180Q3U827 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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Rnf180Q3U827 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf180Q3U827 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf180Q3U827 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf180Q3U827 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf180Q3U827 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf180Q3U827 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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Rnf180Q3U827 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf180Q3U827 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf180Q3U827 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf180Q3U827 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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Rnf180Q3U827 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf180Q3U827 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf180Q3U827 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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Rnf180Q3U827 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf180Q3U827 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf180Q3U827 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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Rnf180Q3U827 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf180Q3U827 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf180Q3U827 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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Rnf180Q3U827 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf180Q3U827 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf180Q3U827 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf180Q3U827 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf180Q3U827 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf180Q3U827 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rnf180Q3U827 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rnf180Q3U827 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf180Q3U827 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf180Q3U827 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf180Q3U827 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf180Q3U827 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf180Q3U827 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf180Q3U827 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf180Q3U827 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf180Q3U827 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf180Q3U827 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf180Q3U827 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
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