Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q3U6N9 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q3U6N9 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q3U6N9 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q3U6N9 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q3U6N9 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q3U6N9 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Q3U6N9 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Q3U6N9 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q3U6N9 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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