Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Ssbp4Q3U4B1 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Ssbp4Q3U4B1 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Ssbp4Q3U4B1 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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