Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
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Ulk3Q3U3Q1 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ulk3Q3U3Q1 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ulk3Q3U3Q1 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Ulk3Q3U3Q1 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Ulk3Q3U3Q1 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
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Ulk3Q3U3Q1 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Ulk3Q3U3Q1 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ulk3Q3U3Q1 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ulk3Q3U3Q1 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ulk3Q3U3Q1 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ulk3Q3U3Q1 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ulk3Q3U3Q1 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ulk3Q3U3Q1 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ulk3Q3U3Q1 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ulk3Q3U3Q1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Ulk3Q3U3Q1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ulk3Q3U3Q1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ulk3Q3U3Q1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ulk3Q3U3Q1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ulk3Q3U3Q1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ulk3Q3U3Q1 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms