Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S8

Hvcn1, Voltage-gated hydrogen channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hvcn1Q3U2S8 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hvcn1Q3U2S8 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hvcn1Q3U2S8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hvcn1Q3U2S8 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hvcn1Q3U2S8 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hvcn1Q3U2S8 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hvcn1Q3U2S8 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Hvcn1Q3U2S8 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hvcn1Q3U2S8 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hvcn1Q3U2S8 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hvcn1Q3U2S8 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hvcn1Q3U2S8 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hvcn1Q3U2S8 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Hvcn1Q3U2S8 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hvcn1Q3U2S8 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hvcn1Q3U2S8 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hvcn1Q3U2S8 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hvcn1Q3U2S8 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hvcn1Q3U2S8 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hvcn1Q3U2S8 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hvcn1Q3U2S8 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hvcn1Q3U2S8 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hvcn1Q3U2S8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hvcn1Q3U2S8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hvcn1Q3U2S8 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hvcn1Q3U2S8 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hvcn1Q3U2S8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hvcn1Q3U2S8 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hvcn1Q3U2S8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hvcn1Q3U2S8 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hvcn1Q3U2S8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hvcn1Q3U2S8 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hvcn1Q3U2S8 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hvcn1Q3U2S8 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Hvcn1Q3U2S8 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hvcn1Q3U2S8 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hvcn1Q3U2S8 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hvcn1Q3U2S8 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hvcn1Q3U2S8 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hvcn1Q3U2S8 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hvcn1Q3U2S8 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hvcn1Q3U2S8 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hvcn1Q3U2S8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hvcn1Q3U2S8 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hvcn1Q3U2S8 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hvcn1Q3U2S8 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hvcn1Q3U2S8 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hvcn1Q3U2S8 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hvcn1Q3U2S8 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hvcn1Q3U2S8 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hvcn1Q3U2S8 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hvcn1Q3U2S8 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hvcn1Q3U2S8 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hvcn1Q3U2S8 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hvcn1Q3U2S8 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hvcn1Q3U2S8 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Hvcn1Q3U2S8 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hvcn1Q3U2S8 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hvcn1Q3U2S8 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hvcn1Q3U2S8 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hvcn1Q3U2S8 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hvcn1Q3U2S8 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hvcn1Q3U2S8 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hvcn1Q3U2S8 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hvcn1Q3U2S8 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hvcn1Q3U2S8 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hvcn1Q3U2S8 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hvcn1Q3U2S8 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hvcn1Q3U2S8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Hvcn1Q3U2S8 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hvcn1Q3U2S8 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hvcn1Q3U2S8 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hvcn1Q3U2S8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hvcn1Q3U2S8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hvcn1Q3U2S8 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hvcn1Q3U2S8 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hvcn1Q3U2S8 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hvcn1Q3U2S8 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hvcn1Q3U2S8 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hvcn1Q3U2S8 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hvcn1Q3U2S8 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hvcn1Q3U2S8 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hvcn1Q3U2S8 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hvcn1Q3U2S8 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hvcn1Q3U2S8 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hvcn1Q3U2S8 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hvcn1Q3U2S8 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hvcn1Q3U2S8 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hvcn1Q3U2S8 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hvcn1Q3U2S8 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hvcn1Q3U2S8 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hvcn1Q3U2S8 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hvcn1Q3U2S8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hvcn1Q3U2S8 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hvcn1Q3U2S8 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hvcn1Q3U2S8 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hvcn1Q3U2S8 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hvcn1Q3U2S8 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hvcn1Q3U2S8 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hvcn1Q3U2S8 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms