Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1J0

Slc38a5, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 5, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a5Q3U1J0 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc38a5Q3U1J0 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc38a5Q3U1J0 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc38a5Q3U1J0 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc38a5Q3U1J0 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc38a5Q3U1J0 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc38a5Q3U1J0 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc38a5Q3U1J0 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc38a5Q3U1J0 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc38a5Q3U1J0 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc38a5Q3U1J0 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc38a5Q3U1J0 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc38a5Q3U1J0 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc38a5Q3U1J0 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc38a5Q3U1J0 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc38a5Q3U1J0 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc38a5Q3U1J0 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc38a5Q3U1J0 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc38a5Q3U1J0 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms