Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1D9

UPF0602 protein C4orf47 homolog, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U1D9 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Q3U1D9 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Q3U1D9 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q3U1D9 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q3U1D9 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q3U1D9 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q3U1D9 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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