Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms