Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0V2

Tradd, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TraddQ3U0V2 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TraddQ3U0V2 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TraddQ3U0V2 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TraddQ3U0V2 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TraddQ3U0V2 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TraddQ3U0V2 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TraddQ3U0V2 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TraddQ3U0V2 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TraddQ3U0V2 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TraddQ3U0V2 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TraddQ3U0V2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TraddQ3U0V2 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TraddQ3U0V2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TraddQ3U0V2 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TraddQ3U0V2 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TraddQ3U0V2 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TraddQ3U0V2 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TraddQ3U0V2 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TraddQ3U0V2 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TraddQ3U0V2 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TraddQ3U0V2 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TraddQ3U0V2 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TraddQ3U0V2 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TraddQ3U0V2 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TraddQ3U0V2 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TraddQ3U0V2 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TraddQ3U0V2 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TraddQ3U0V2 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TraddQ3U0V2 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TraddQ3U0V2 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TraddQ3U0V2 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TraddQ3U0V2 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TraddQ3U0V2 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TraddQ3U0V2 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TraddQ3U0V2 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TraddQ3U0V2 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TraddQ3U0V2 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TraddQ3U0V2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TraddQ3U0V2 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TraddQ3U0V2 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TraddQ3U0V2 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TraddQ3U0V2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TraddQ3U0V2 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TraddQ3U0V2 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TraddQ3U0V2 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TraddQ3U0V2 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TraddQ3U0V2 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TraddQ3U0V2 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TraddQ3U0V2 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TraddQ3U0V2 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TraddQ3U0V2 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TraddQ3U0V2 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TraddQ3U0V2 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TraddQ3U0V2 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TraddQ3U0V2 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TraddQ3U0V2 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TraddQ3U0V2 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TraddQ3U0V2 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TraddQ3U0V2 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TraddQ3U0V2 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TraddQ3U0V2 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TraddQ3U0V2 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TraddQ3U0V2 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TraddQ3U0V2 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TraddQ3U0V2 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TraddQ3U0V2 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TraddQ3U0V2 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TraddQ3U0V2 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TraddQ3U0V2 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TraddQ3U0V2 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TraddQ3U0V2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TraddQ3U0V2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TraddQ3U0V2 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TraddQ3U0V2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TraddQ3U0V2 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TraddQ3U0V2 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TraddQ3U0V2 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TraddQ3U0V2 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TraddQ3U0V2 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TraddQ3U0V2 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TraddQ3U0V2 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TraddQ3U0V2 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TraddQ3U0V2 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TraddQ3U0V2 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TraddQ3U0V2 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TraddQ3U0V2 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TraddQ3U0V2 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TraddQ3U0V2 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TraddQ3U0V2 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TraddQ3U0V2 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TraddQ3U0V2 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TraddQ3U0V2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TraddQ3U0V2 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TraddQ3U0V2 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TraddQ3U0V2 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TraddQ3U0V2 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TraddQ3U0V2 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TraddQ3U0V2 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TraddQ3U0V2 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TraddQ3U0V2 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms