Protein–RNA interactions for Protein: Q3TT99

Gdpd4, Glycerophosphodiester phosphodiesterase domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 632 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd4Q3TT99 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Gdpd4Q3TT99 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Gdpd4Q3TT99 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Gdpd4Q3TT99 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gdpd4Q3TT99 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gdpd4Q3TT99 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gdpd4Q3TT99 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Gdpd4Q3TT99 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gdpd4Q3TT99 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gdpd4Q3TT99 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Gdpd4Q3TT99 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gdpd4Q3TT99 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gdpd4Q3TT99 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gdpd4Q3TT99 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gdpd4Q3TT99 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gdpd4Q3TT99 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gdpd4Q3TT99 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gdpd4Q3TT99 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms