Protein–RNA interactions for Protein: Q3TSA9

Fbxw18, Expressed sequence C85627, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxw18Q3TSA9 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms