Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms