Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gtf3c3Q3TMP1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gtf3c3Q3TMP1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gtf3c3Q3TMP1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gtf3c3Q3TMP1 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gtf3c3Q3TMP1 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gtf3c3Q3TMP1 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gtf3c3Q3TMP1 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gtf3c3Q3TMP1 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
Gtf3c3Q3TMP1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gtf3c3Q3TMP1 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gtf3c3Q3TMP1 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gtf3c3Q3TMP1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms