Protein–RNA interactions for Protein: Q3TGF2

Fam107b, Protein FAM107B, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam107bQ3TGF2 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms