Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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