Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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