Protein–RNA interactions for Protein: Q1HCM0

Fgfbp3, Fibroblast growth factor-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfbp3Q1HCM0 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms