Protein–RNA interactions for Protein: Q1EHW4

Sap25, Histone deacetylase complex subunit SAP25, mousemouse

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap25Q1EHW4 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
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Sap25Q1EHW4 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Sap25Q1EHW4 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Sap25Q1EHW4 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sap25Q1EHW4 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sap25Q1EHW4 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sap25Q1EHW4 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sap25Q1EHW4 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sap25Q1EHW4 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sap25Q1EHW4 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Sap25Q1EHW4 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sap25Q1EHW4 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sap25Q1EHW4 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sap25Q1EHW4 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sap25Q1EHW4 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sap25Q1EHW4 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sap25Q1EHW4 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
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Sap25Q1EHW4 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sap25Q1EHW4 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sap25Q1EHW4 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sap25Q1EHW4 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sap25Q1EHW4 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sap25Q1EHW4 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sap25Q1EHW4 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sap25Q1EHW4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sap25Q1EHW4 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sap25Q1EHW4 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sap25Q1EHW4 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sap25Q1EHW4 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sap25Q1EHW4 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sap25Q1EHW4 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sap25Q1EHW4 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sap25Q1EHW4 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sap25Q1EHW4 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sap25Q1EHW4 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sap25Q1EHW4 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sap25Q1EHW4 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sap25Q1EHW4 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sap25Q1EHW4 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sap25Q1EHW4 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sap25Q1EHW4 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sap25Q1EHW4 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sap25Q1EHW4 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sap25Q1EHW4 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sap25Q1EHW4 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sap25Q1EHW4 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sap25Q1EHW4 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sap25Q1EHW4 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sap25Q1EHW4 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sap25Q1EHW4 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sap25Q1EHW4 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sap25Q1EHW4 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms