Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms