Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms