Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE29

Samd12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd12Q0VE29 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Samd12Q0VE29 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Samd12Q0VE29 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Samd12Q0VE29 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Samd12Q0VE29 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Samd12Q0VE29 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Samd12Q0VE29 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Samd12Q0VE29 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Samd12Q0VE29 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Samd12Q0VE29 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Samd12Q0VE29 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Samd12Q0VE29 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Samd12Q0VE29 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Samd12Q0VE29 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Samd12Q0VE29 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Samd12Q0VE29 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Samd12Q0VE29 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Samd12Q0VE29 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Samd12Q0VE29 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Samd12Q0VE29 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Samd12Q0VE29 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Samd12Q0VE29 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Samd12Q0VE29 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Samd12Q0VE29 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Samd12Q0VE29 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Samd12Q0VE29 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Samd12Q0VE29 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Samd12Q0VE29 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Samd12Q0VE29 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Samd12Q0VE29 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Samd12Q0VE29 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Samd12Q0VE29 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Samd12Q0VE29 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Samd12Q0VE29 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Samd12Q0VE29 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Samd12Q0VE29 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Samd12Q0VE29 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Samd12Q0VE29 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Samd12Q0VE29 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Samd12Q0VE29 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Samd12Q0VE29 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Samd12Q0VE29 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Samd12Q0VE29 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Samd12Q0VE29 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Samd12Q0VE29 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Samd12Q0VE29 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Samd12Q0VE29 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Samd12Q0VE29 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Samd12Q0VE29 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Samd12Q0VE29 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Samd12Q0VE29 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Samd12Q0VE29 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Samd12Q0VE29 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Samd12Q0VE29 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Samd12Q0VE29 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Samd12Q0VE29 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Samd12Q0VE29 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Samd12Q0VE29 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Samd12Q0VE29 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Samd12Q0VE29 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Samd12Q0VE29 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Samd12Q0VE29 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Samd12Q0VE29 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Samd12Q0VE29 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Samd12Q0VE29 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Samd12Q0VE29 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Samd12Q0VE29 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Samd12Q0VE29 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Samd12Q0VE29 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Samd12Q0VE29 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Samd12Q0VE29 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Samd12Q0VE29 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Samd12Q0VE29 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Samd12Q0VE29 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Samd12Q0VE29 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Samd12Q0VE29 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Samd12Q0VE29 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Samd12Q0VE29 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Samd12Q0VE29 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Samd12Q0VE29 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Samd12Q0VE29 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Samd12Q0VE29 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Samd12Q0VE29 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Samd12Q0VE29 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Samd12Q0VE29 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Samd12Q0VE29 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Samd12Q0VE29 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Samd12Q0VE29 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Samd12Q0VE29 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Samd12Q0VE29 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Samd12Q0VE29 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Samd12Q0VE29 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Samd12Q0VE29 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Samd12Q0VE29 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Samd12Q0VE29 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Samd12Q0VE29 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Samd12Q0VE29 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Samd12Q0VE29 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Samd12Q0VE29 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Samd12Q0VE29 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms