Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T8

Cntnap5b, Contactin-associated protein like 5-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5bQ0V8T8 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cntnap5bQ0V8T8 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cntnap5bQ0V8T8 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cntnap5bQ0V8T8 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cntnap5bQ0V8T8 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cntnap5bQ0V8T8 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cntnap5bQ0V8T8 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cntnap5bQ0V8T8 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cntnap5bQ0V8T8 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cntnap5bQ0V8T8 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cntnap5bQ0V8T8 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cntnap5bQ0V8T8 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Cntnap5bQ0V8T8 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms