Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms