Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms