Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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