Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms