Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms