Protein–RNA interactions for Protein: Q05909

Ptprg, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprgQ05909 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms