Protein–RNA interactions for Protein: Q05860

Fmn1, Formin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmn1Q05860 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fmn1Q05860 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fmn1Q05860 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fmn1Q05860 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fmn1Q05860 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fmn1Q05860 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fmn1Q05860 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fmn1Q05860 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fmn1Q05860 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fmn1Q05860 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fmn1Q05860 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fmn1Q05860 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fmn1Q05860 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fmn1Q05860 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Fmn1Q05860 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fmn1Q05860 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fmn1Q05860 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fmn1Q05860 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fmn1Q05860 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fmn1Q05860 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fmn1Q05860 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fmn1Q05860 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fmn1Q05860 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fmn1Q05860 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fmn1Q05860 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fmn1Q05860 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fmn1Q05860 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fmn1Q05860 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fmn1Q05860 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fmn1Q05860 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fmn1Q05860 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fmn1Q05860 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Fmn1Q05860 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Fmn1Q05860 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Fmn1Q05860 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fmn1Q05860 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fmn1Q05860 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fmn1Q05860 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fmn1Q05860 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fmn1Q05860 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fmn1Q05860 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fmn1Q05860 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fmn1Q05860 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fmn1Q05860 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fmn1Q05860 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Fmn1Q05860 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Fmn1Q05860 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fmn1Q05860 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fmn1Q05860 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fmn1Q05860 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fmn1Q05860 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fmn1Q05860 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fmn1Q05860 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fmn1Q05860 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fmn1Q05860 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fmn1Q05860 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fmn1Q05860 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fmn1Q05860 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fmn1Q05860 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fmn1Q05860 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fmn1Q05860 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fmn1Q05860 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fmn1Q05860 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fmn1Q05860 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Fmn1Q05860 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Fmn1Q05860 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Fmn1Q05860 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Fmn1Q05860 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Fmn1Q05860 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Fmn1Q05860 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Fmn1Q05860 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fmn1Q05860 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fmn1Q05860 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fmn1Q05860 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fmn1Q05860 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fmn1Q05860 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Fmn1Q05860 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fmn1Q05860 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Fmn1Q05860 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fmn1Q05860 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fmn1Q05860 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fmn1Q05860 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fmn1Q05860 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fmn1Q05860 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Fmn1Q05860 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fmn1Q05860 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fmn1Q05860 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Fmn1Q05860 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fmn1Q05860 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fmn1Q05860 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fmn1Q05860 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fmn1Q05860 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fmn1Q05860 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fmn1Q05860 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fmn1Q05860 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fmn1Q05860 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fmn1Q05860 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fmn1Q05860 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fmn1Q05860 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fmn1Q05860 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms