Protein–RNA interactions for Protein: Q04899

Cdk18, Cyclin-dependent kinase 18, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk18Q04899 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms