Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms