Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms