Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms