Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms