Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms