Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkcqQ02111 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkcqQ02111 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkcqQ02111 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkcqQ02111 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkcqQ02111 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkcqQ02111 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkcqQ02111 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkcqQ02111 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkcqQ02111 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkcqQ02111 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkcqQ02111 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkcqQ02111 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkcqQ02111 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkcqQ02111 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkcqQ02111 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkcqQ02111 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkcqQ02111 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkcqQ02111 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkcqQ02111 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkcqQ02111 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkcqQ02111 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkcqQ02111 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkcqQ02111 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkcqQ02111 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkcqQ02111 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcqQ02111 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcqQ02111 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcqQ02111 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcqQ02111 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcqQ02111 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcqQ02111 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcqQ02111 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcqQ02111 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcqQ02111 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcqQ02111 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcqQ02111 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcqQ02111 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcqQ02111 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcqQ02111 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcqQ02111 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcqQ02111 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcqQ02111 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcqQ02111 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcqQ02111 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcqQ02111 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcqQ02111 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcqQ02111 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcqQ02111 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcqQ02111 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcqQ02111 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcqQ02111 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcqQ02111 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcqQ02111 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcqQ02111 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcqQ02111 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcqQ02111 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcqQ02111 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcqQ02111 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcqQ02111 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcqQ02111 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcqQ02111 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcqQ02111 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcqQ02111 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcqQ02111 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcqQ02111 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcqQ02111 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcqQ02111 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcqQ02111 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcqQ02111 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcqQ02111 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcqQ02111 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcqQ02111 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcqQ02111 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcqQ02111 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcqQ02111 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcqQ02111 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcqQ02111 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcqQ02111 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcqQ02111 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcqQ02111 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcqQ02111 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcqQ02111 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcqQ02111 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcqQ02111 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcqQ02111 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcqQ02111 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcqQ02111 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcqQ02111 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcqQ02111 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcqQ02111 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcqQ02111 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcqQ02111 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcqQ02111 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcqQ02111 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcqQ02111 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcqQ02111 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms