Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VcpQ01853 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VcpQ01853 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VcpQ01853 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
VcpQ01853 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VcpQ01853 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VcpQ01853 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VcpQ01853 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VcpQ01853 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms