Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms