Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Top2aQ01320 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms