Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms